Parlamentarios de la UDI presentaron un oficio en contraloría contra Ana Lya Uriarte.
Acusan que "operadores políticos" se han "apernado" en los cargos y los llaman a salir del sistema.
Diputados socialistas anunciaron que solicitarán una comisión investigadora.
El informe contempla 380 actividades públicas de la Jefa de Estado.
Según Contraloría, la salida de los pacientes fue sólo "administrativa".
Licitación había sido rechazada anteriormente en dos ocasiones.
El CFA advirtió que se podría concretar "el cuarto incumplimiento consecutivo de la meta de Balance Estructural (BE), que incluso podría ser de un nivel mayor a lo proyectado debido a riesgos de desviaciones en los ingresos y gastos fiscales".